RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-210ENST00000560934 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NOMO3P69849 1222 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 METRNLQ641Q3 311 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CNBD1Q8NA66 436 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NEU1Q99519 415 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 TEX101Q9BY14 249 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NYXQ9GZU5 481 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 L1RE1Q9UN81 338 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM50BQ9Y247 325 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.32□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ABCC12Q96J65 1359 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CAPN8A6NHC0 703 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM227AF5H4B4 570 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZNF185O15231 689 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NPHP1O15259 732 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM20BO75063 409 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CAND2O75155 1236 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 HAUS5O94927 633 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KITP10721 976 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZNF20P17024 532 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 PIK3CGP48736 1102 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ADAM17P78536 824 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NUCB1Q02818 461 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CDSNQ15517 529 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CCDC57Q2TAC2 916 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 LRRC24Q50LG9 513 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 HTR3DQ70Z44 454 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 GCC1Q96CN9 775 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SIL1Q9H173 461 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 BRD9Q9H8M2 597 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 JKAMPQ9P055 326 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.31□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 EP400Q96L91 3159 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CCDC78A2IDD5 438 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CFAP69A5D8W1 941 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 EYA2O00167 538 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 MATN4O95460 622 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZBED1O96006 694 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 GJB1P08034 283 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CKBP12277 381 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RHCEP18577 417 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ACRV1P26436 265 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 GPSM2P81274 684 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RHDQ02161 417 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CRY2Q49AN0 593 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 RNF220Q5VTB9 566 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 ZNF365Q70YC5 407 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.3□□□□□ -1.56
LINS1-210ENST00000560934 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms