RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 SYT5O00445 386 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 EXOC5O00471 708 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SH3BP5O60239 455 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RASSF9O75901 435 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 IDEP14735 1019 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ZACNQ401N2 412 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PDPRQ8NCN5 879 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 OR14A2Q96R54 314 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RNF114Q9Y508 228 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM233B4DJY2 109 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 E9PLN8 166 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PODXLO00592 558 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CCP110O43303 1012 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HSD3B1P14060 373 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SLC6A2P23975 617 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ACVR2AP27037 513 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SATB1Q01826 763 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ALFQ53S48 1182 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF384Q8TF68 577 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HESX1Q9UBX0 185 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MID2Q9UJV3 735 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 BCL9O00512 1426 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 EP400Q96L91 3159 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 DRGXA6NNA5 263 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 RAD17O75943 681 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 KIF20AO95235 890 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FDXRP22570 491 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GCSHP23434 173 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 COPAP53621 1224 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PTTG1IPP53801 180 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SLFN5Q08AF3 891 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FOXO1Q12778 655 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SLC29A2Q14542 456 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CSRP2Q16527 193 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PFKFB4Q16877 469 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 INSCQ1MX18 579 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MED25Q71SY5 747 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC46Q96FV0 321 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SMOQ99835 787 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GDF15Q99988 308 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CASS4Q9NQ75 786 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ADAMTS20P59510 1910 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 SLIT3O75094 1523 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC7Q96M83 1385 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 FAM234BA2RU67 622 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 PAX4O43316 350 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 A1BGP04217 495 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CKBP12277 381 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 CHN2P52757 468 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF844Q08AG5 666 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 KRT73Q86Y46 540 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 D2HGDHQ8N465 521 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MB21D1Q8N884 522 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 MIEF2Q96C03 454 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms