RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SYT13Q7L8C5 426 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 KBTBD6Q86V97 674 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 HPS3Q969F9 1004 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MYLPFQ96A32 169 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ACDQ96AP0 544 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 DHX58Q96C10 678 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 C8orf48Q96LL4 319 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EBF1Q9UH73 591 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SPTBN2O15020 2390 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CLIC2O15247 247 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TGFB1I1O43294 461 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PHACTR2O75167 634 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TADA3O75528 432 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RHOBTB1O94844 696 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EPN2O95208 641 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 YEATS4O95619 227 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 NFATC1O95644 943 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 APBB3O95704 486 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ABL1P00519 1130 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TCF3P15923 654 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CYP2J2P51589 502 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 DMC1Q14565 340 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PSMD6Q15008 389 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ELF2Q15723 593 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 E2F4Q16254 413 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PPM1JQ5JR12 505 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RIN3Q8TB24 985 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PCED1BQ96HM7 432 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CGRRF1Q99675 332 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PTPRJQ12913 1337 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PATJQ8NI35 1801 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SCN1AP35498 2009 aa8.7□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 A8MXQ7 604 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 F8VP50 259 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 LEFTY2O00292 366 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EXOC3O60645 756 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ADRB1P08588 477 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ATICP31939 592 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ME1P48163 572 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 DGKEP52429 567 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 LIMK1P53667 647 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 MYL6P60660 151 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 USP46P62068 366 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SLC7A9P82251 487 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CYP24A1Q07973 514 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TAF10Q12962 218 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 USP4Q13107 963 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CCDC6Q16204 474 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PLK5Q496M5 336 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 C2orf27AQ580R0 203 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SHC4Q6S5L8 630 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 UNC13DQ70J99 1090 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 HHIPQ96QV1 700 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 BACH2Q9BYV9 841 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.69□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RNF38Q9H0F5 515 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms