RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PRR29	P0C7W0	189 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	IDE	P14735	1019 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CYP2F1	P24903	491 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAGEA11	P43364	429 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ACAP1	Q15027	740 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	E2F4	Q16254	413 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DDR2	Q16832	855 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	C2orf27A	Q580R0	203 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	EOGT	Q5NDL2	527 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ATL3	Q6DD88	541 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	VSTM1	Q6UX27	236 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SFR1	Q86XK3	245 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CEP76	Q8TAP6	659 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	WHAMM	Q8TF30	809 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PIGK	Q92643	395 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SPATA17	Q96L03	361 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FIZ1	Q96SL8	496 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	INVS	Q9Y283	1065 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MYH11	P35749	1972 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRIP11	Q15643	1979 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CIT	O14578	2027 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PATE3	B3GLJ2	98 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ADSS	P30520	456 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	OPRD1	P41143	372 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	P2RY2	P41231	377 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GRIA2	P42262	883 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SYK	P43405	635 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF4	P43489	277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GPR15	P49685	360 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CDR1	P51861	262 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ASIC1	P78348	528 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC7A9	P82251	487 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	RBP5	P82980	135 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	MYO1E	Q12965	1108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CUL4B	Q13620	913 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	FAM171B	Q6P995	826 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	DEFB124	Q8NES8	71 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	SLC22A12	Q96S37	553 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PNKP	Q96T60	521 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	PKMYT1	Q99640	499 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CS-233	ENST00000552688	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		7.32	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms