RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PIGZQ86VD9 579 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 VPS36Q86VN1 386 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SAMD11Q96NU1 681 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DUSP16Q9BY84 665 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 THAP2Q9H0W7 228 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FNIP2Q9P278 1114 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HESX1Q9UBX0 185 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PIEZO1Q92508 2521 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PLXNA3P51805 1871 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PATJQ8NI35 1801 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 E5RJQ4 531 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TGM5O43548 720 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NRDCO43847 1150 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RTN2O75298 545 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 H2AFZP0C0S5 128 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SPATA31D3P0C874 917 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SETSIPP0DME0 302 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ATF6P18850 670 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RRM1P23921 792 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PLA2G4AP47712 749 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NDUFV1P49821 464 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 VAV2P52735 878 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ADCY1Q08828 1119 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DUSP4Q13115 394 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SPA17Q15506 151 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DDR2Q16832 855 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 H2AFVQ71UI9 128 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPR65Q8IYL9 337 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPR152Q8TDT2 470 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ZNF653Q96CK0 615 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRIM7Q9C029 511 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CEP83Q9Y592 693 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 IRAK3Q9Y616 596 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NCANO14594 1321 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ANKRD62A6NC57 917 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TNFRSF10BO14763 440 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PJA2O43164 708 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CCDC175P0C221 793 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TMEM253P0C7T8 217 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LCP1P13796 627 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ATF2P15336 505 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GRIK1P39086 918 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MAGEA11P43364 429 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GABRB2P47870 512 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PGFP49763 221 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 USP46P62068 366 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ADIGQ0VDE8 80 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MTMR3Q13615 1198 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RAB41Q5JT25 222 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TRNP1Q6NT89 227 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LILRA6Q6PI73 481 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms