RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 COL4A5P29400 1685 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KLRC4O43908 158 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZEB2O60315 1214 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 BRINP1O60477 761 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SMC2O95347 1197 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TDP2O95551 362 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NDUFB10O96000 172 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 OR52Z1P0C646 297 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZNF18P17022 549 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ECE1P42892 770 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LSSP48449 732 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PRELPP51888 382 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SNAP25P60880 206 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 OCRLQ01968 901 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MYL5Q02045 173 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LRMPQ12912 555 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CUL4BQ13620 913 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 UBE2SQ16763 222 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 FAM83AQ86UY5 434 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 C11orf74Q86VG3 221 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DRC7Q8IY82 874 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ACER1Q8TDN7 264 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 HAS1Q92839 578 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 GSDMAQ96QA5 445 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ADOQ96SZ5 270 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 EMC7Q9NPA0 242 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 IFNKQ9P0W0 207 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMX2Q9Y320 296 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.04□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CHD4Q14839 1912 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RASSF10A6NK89 507 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMEM232C9JQI7 657 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 WNT10BO00744 389 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MEIS2O14770 477 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TGM5O43548 720 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SLC37A4O43826 429 aa6.03□□□□□ -1.44
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TRDN-205ENST00000546248 MMEP08473 750 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 POLD1P28340 1107 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TECP42680 631 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TPM4P67936 248 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMPRSS15P98073 1019 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 FOXE3Q13461 319 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PDIA5Q14554 519 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 FUKQ8N0W3 1084 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 EFHBQ8N7U6 833 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 AK8Q96MA6 479 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MBOAT7Q96N66 472 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PLIN2Q99541 437 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 ACSS2Q9NR19 701 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 INTS13Q9NVM9 706 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.03□□□□□ -1.44
TRDN-205ENST00000546248 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.02□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.02□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FZD9O00144 591 aa6.02□□□□□ -1.45
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