RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PLEKHG3A1L390 1219 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CAPN8A6NHC0 703 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC154A6NI56 674 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 O00370 1275 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SIAH2O43255 324 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GAS7O60861 476 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 GTF2H3Q13889 308 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KCTD2Q14681 263 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPK6Q16659 721 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 UNC13DQ70J99 1090 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SZRD1Q7Z422 152 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 P3H2Q8IVL5 708 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MIPEPQ99797 713 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CABP1Q9NZU7 370 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MCM8Q9UJA3 840 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD28O15084 1053 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RAD51CO43502 376 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GMFGO60234 142 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TOM1O60784 492 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GLRA3O75311 464 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNK5O95279 499 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNE2O96020 404 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINA3P01011 423 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ANXA5P08758 320 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 BCRP11274 1271 aa3.26□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 MAGEA4P43358 317 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TGM4P49221 684 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PDE4BQ07343 736 aa3.26□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 SLC3A1Q07837 685 aa3.26□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 TCEA2Q15560 299 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CA9Q16790 459 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ADSSL1Q8N142 457 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TRPV1Q8NER1 839 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SSH3Q8TE77 659 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CHP1Q99653 195 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EHD4Q9H223 541 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 THAP9Q9H5L6 903 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa3.26□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.898e-7■■■□□ 19.1
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JMJD1C-210ENST00000542921 C20orf202A1L168 122 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SGK1O00141 431 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC16A8O95907 504 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ATF2P15336 505 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OSBPP22059 807 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ACTR3P61158 418 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ARF5P84085 180 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC58Q4VC31 144 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 XKR3Q5GH77 459 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TRNP1Q6NT89 227 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.25□□□□□ -1.89
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