RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 CXCL12P48061 93 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 VAMP7P51809 220 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 NRLP54845 237 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 CLDN10P78369 228 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 NUCB2P80303 420 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 AMPD2Q01433 879 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 ADAM9Q13443 819 aa9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 RUNX3Q13761 415 aa9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
LMO3-222ENST00000540445 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.6□□□□□ -0.87
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-222ENST00000540445 MTF1Q14872 753 aa9.58□□□□□ -0.88
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.58□□□□□ -0.88
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LMO3-222ENST00000540445 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-222ENST00000540445 HPS4Q9NQG7 708 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-222ENST00000540445 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-222ENST00000540445 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-222ENST00000540445 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.57□□□□□ -0.88
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