RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 OSTM1Q86WC4 334 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMC8Q8IU68 726 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 HPDLQ96IR7 371 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMA1P25391 3075 aa20.61■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 HUS1O60921 280 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH1A3P47895 512 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMPD2Q01433 879 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNB1Q14721 858 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LNP1A1A4G5 178 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNK2Q07912 1038 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO1EQ12965 1108 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP135Q66GS9 1140 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 DLG4P78352 724 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC142Q17RM4 750 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf74Q86VG3 221 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 EXOC4Q96A65 974 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.58■□□□□ 0.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBXO43Q4G163 708 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR158Q5T848 1215 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAREM2Q75VX8 874 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITIH5Q86UX2 942 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSMG2Q969U7 264 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL26A1Q96A83 441 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 EBF1Q9UH73 591 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.57■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF20AO95235 890 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYL6P60660 151 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSPY1Q01534 308 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMS19Q96T76 1030 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TASP1Q9H6P5 420 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAF4O00268 1085 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABRDO14764 452 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHACTR2O75167 634 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 APBB3O95704 486 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATF6P18850 670 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 DRD1P21728 446 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 NR2F2P24468 414 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMO2P25791 158 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GABRR2P28476 465 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYL7Q01449 175 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 BIRC3Q13489 604 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPC3Q13507 836 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYT13Q7L8C5 426 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 GIPC2Q8TF65 315 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 TIGD1Q96MW7 591 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACBD6Q9BR61 282 aa20.55■□□□□ 0.88
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms