RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 NRLP54845 237 aa26.56■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 GAS6Q14393 721 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 PDGFRLQ15198 375 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 Q6ZS52 159 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 MED10Q9BTT4 135 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.55■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 PATJQ8NI35 1801 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 SDCBP2Q9H190 292 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 ATP8B3O60423 1300 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 F5P12259 2224 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 FRYLO94915 3013 aa26.54■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 KRT13P13646 458 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 PPP3CCP48454 512 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 IFNAR2P48551 515 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 CPA6Q8N4T0 437 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 TAF4BQ92750 862 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-206ENST00000534219 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 217.6
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PTPRJ-206ENST00000534219 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.52■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.52■■□□□ 1.84
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PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM49CP0CI26 452 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA2013Q8IYS2 634 aa26.51■■□□□ 1.83
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PTPRJ-206ENST00000534219 NDST1P52848 882 aa26.5■■□□□ 1.83
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PTPRJ-206ENST00000534219 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM186AA6NE01 2351 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 GJA4P35212 333 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 GALK1P51570 392 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRJ-206ENST00000534219 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.49■■□□□ 1.83
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