RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999		E7ESA3	106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	SGK1	O00141	431 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	HAS3	O00219	553 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	TCF4	P15884	667 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	IL1R2	P27930	398 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	CPT1A	P50416	773 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ADAM17	P78536	824 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	MAML1	Q92585	1016 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF560	Q96MR9	790 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PUF60-213	ENST00000528999	ANK1	P16157	1881 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PIR	O00625	290 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MCF2L	O15068	1137 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MDM4	O15151	490 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62	2e-6	■■□□□ 12.4
PUF60-213	ENST00000528999	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SPAG6	O75602	509 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NPTXR	O95502	500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PFKM	P08237	780 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	TGM2	P21980	687 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PTPN9	P43378	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	XRCC4	Q13426	336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SETD4	Q9NVD3	440 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	GSTA2	P09210	222 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	CYP2C9	P11712	490 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	BRAF	P15056	766 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SDC4	P31431	198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MAGEA6	P43360	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NR2C2	P49116	596 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	VPS41	P49754	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	IFT88	Q13099	833 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	MFSD10	Q14728	455 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PUF60-213	ENST00000528999	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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