RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAK2	Q13177	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	NNT	Q13423	1086 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACAP1	Q15027	740 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LPP	Q93052	612 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GAD1	Q99259	594 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADAM2	Q99965	735 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYH10	P35580	1976 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854		C9IYK1	514 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854		E5RJQ4	531 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TULP2	O00295	520 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNM1L	O00429	736 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PODXL	O00592	558 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYB561D2	O14569	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	AXIN1	O15169	862 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTI1	O43156	1089 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	HCRT	O43612	131 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADAM23	O75077	832 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRCH4	O75427	683 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	EOMES	O95936	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	TCF4	P15884	667 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	YY1	P25490	414 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSMA2	P25787	234 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ECHS1	P30084	290 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPN7	P35236	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCK1	P35558	622 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCNN1A	P37088	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	LHX1	P48742	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FNTA	P49354	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCNN1G	P51170	649 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	CLCNKB	P51801	687 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	BCAT1	P54687	386 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNX16	P57768	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM189B	P81408	668 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	HTRA3	P83110	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATP2C1-223	ENST00000515854	DR1	Q01658	176 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms