RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 VPS52Q8N1B4 723 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MREGQ8N565 214 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NLRP4Q96MN2 994 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ASB16Q96NS5 453 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MTMR9Q96QG7 549 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SH3GL2Q99962 352 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ENPP3O14638 875 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 MBTPS2O43462 519 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GCNT3O95395 438 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CD4P01730 458 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FGGP02679 453 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ACADMP11310 421 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CTHP32929 405 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HSD17B3P37058 310 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 COX10Q12887 443 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PEX6Q13608 980 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FXNQ16595 210 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP55Q53EZ4 464 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR59Q6PJI9 974 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CD302Q8IX05 232 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP76Q8TAP6 659 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FRS2Q8WU20 508 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKS1AQ92625 1134 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 STMN2Q93045 179 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TIPINQ9BVW5 301 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRD1A4D1F6 860 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL33A6NCF5 533 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM187AA6NFU0 413 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PRRT4C9JH25 899 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PODXLO00592 558 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FOXP2O15409 715 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 PJA2O43164 708 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 NBNO60934 754 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CYP2D6P10635 497 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GLULP15104 373 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 GRK2P25098 689 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CIITAP33076 1130 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CDK7P50613 346 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 USP11P51784 963 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EPHB1P54762 984 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZBTB16Q05516 673 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.759e-8■■■■□ 24
ANKRD28-213ENST00000498524 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TTMPQ5BVD1 217 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF43Q68DV7 783 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RAD54LQ92698 747 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TOP1MTQ969P6 601 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM20AQ96MK3 541 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 RIT2Q99578 217 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCG4Q9H172 646 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 POLD4Q9HCU8 107 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-213ENST00000498524 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.12□□□□□ -1.75
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