RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	INSIG1	O15503	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	KCNA3	P22001	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PDE6C	P51160	858 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	DGKE	P52429	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PRF1	P14222	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	LRPAP1	P30533	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GPR162	Q16538	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SOCS2	O14508	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	FGA	P02671	866 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	FGB	P02675	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	AKAP5	P24588	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CTBP1	Q13363	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268		H3BNC9	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	A1BG	P04217	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	KRT17	Q04695	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	SEC23B	Q15437	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268		A0A087WWL8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268		A0A088AWK7	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	USP1	O94782	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PRKCB	P05771	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	NPR1	P16066	1061 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ARFIP2	P53365	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP34-222	ENST00000498268	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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