RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495434.1

MRPL55-232, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL55, Length 224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL55-232ENST00000495434 CLSTN1O94985 981 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 USP17L7P0C7H9 530 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 TCF3P15923 654 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CCNE1P24864 410 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 RAP1GAPP47736 663 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 FZD5Q13467 585 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 IER2Q9BTL4 223 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 COMMD8Q9NX08 183 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 GCNT4Q9P109 453 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 USP34Q70CQ2 3546 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 COL4A3Q01955 1670 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CLDN5O00501 218 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 LRRN2O75325 713 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 MXI1P50539 228 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 NDST1P52848 882 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CACNA2D1P54289 1103 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 USP46P62068 366 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 UBE2HP62256 183 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 ACOT1Q86TX2 421 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 FAM35AQ86V20 835 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 NUP93Q8N1F7 819 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 TTC39CQ8N584 583 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CEP63Q96MT8 703 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 PHOX2BQ99453 314 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 IL37Q9NZH6 218 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 CCL26Q9Y258 94 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.9□□□□□ -0.02
MRPL55-232ENST00000495434 PATJQ8NI35 1801 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 HDCP19113 662 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 CTHP32929 405 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 MORC3Q14149 939 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FUKQ8N0W3 1084 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 MED10Q9BTT4 135 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 GKN1Q9NS71 199 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 RAB20Q9NX57 234 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 MYH10P35580 1976 aa14.89□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 BICDL2A1A5D9 508 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FAM92AA1XBS5 289 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 C2orf78A6NCI8 922 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 TNFRSF10BO14763 440 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 CILPO75339 1184 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 CKMP06732 381 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 YWHAQP27348 245 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 TAF10Q12962 218 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 USP4Q13107 963 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 RUNX3Q13761 415 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 PDGFRLQ15198 375 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ZNF77Q15935 545 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 WDR44Q5JSH3 913 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MRPL55-232ENST00000495434 SEMA4DQ92854 862 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms