RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CACNA1EQ15878 2313 aa24.76■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 HUS1O60921 280 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SV2BQ7L1I2 683 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CXorf38Q8TB03 319 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 USP33Q8TEY7 942 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 STRA6Q9BX79 667 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 TNMDQ9H2S6 317 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM9BQ9NQ34 198 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.75■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ITGB3P05106 788 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CEACAM1P13688 526 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 WNT7BP56706 349 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 AMPD3Q01432 767 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 FSIP1Q8NA03 581 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.74■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 A0A087X0B3 334 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 K7EQS6 105 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 PFKFB1P16118 471 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 OPRD1P41143 372 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 OSTM1Q86WC4 334 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SFR1Q86XK3 245 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 TPSD1Q9BZJ3 242 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 LINC00597Q9H2U6 94 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 INVSQ9Y283 1065 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.73■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf78A6NCI8 922 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 GABRDO14764 452 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 NFATC1O95644 943 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 MYL1P05976 194 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SLFN14P0C7P3 912 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 PFKLP17858 780 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEA11P43364 429 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SYKP43405 635 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 FOXC1Q12948 553 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 KCNB1Q14721 858 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC142Q17RM4 750 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.72■■□□□ 1.55
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SIMC1-208ENST00000495423 TTC16Q8NEE8 873 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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SIMC1-208ENST00000495423 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.72■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 HDCP19113 662 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 BCKDHBP21953 392 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 PCSK1P29120 753 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 LHX1P48742 406 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 PDE6CP51160 858 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 UBE2HP62256 183 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 GAB4Q2WGN9 574 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ANO7Q6IWH7 933 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 FAM171BQ6P995 826 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 PDILTQ8N807 584 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.71■■□□□ 1.55
SIMC1-208ENST00000495423 A0A1B0GVL5 298 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 PATE3B3GLJ2 98 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 KCNA1Q09470 495 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 CRY1Q16526 586 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf27AQ580R0 203 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 DHX58Q96C10 678 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA17Q96L03 361 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.7■■□□□ 1.54
SIMC1-208ENST00000495423 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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