RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 NETO2Q8NC67 525 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CNNM3Q8NE01 707 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FAM151AQ8WW52 585 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ASB11Q8WXH4 323 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 GATA6Q92908 595 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SHISA4Q96DD7 197 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CLIC6Q96NY7 704 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TBCBQ99426 244 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CGRRF1Q99675 332 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PTPN18Q99952 460 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 VAT1LQ9HCJ6 419 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 JADE2Q9NQC1 790 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 BARHL2Q9NY43 387 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 DPP7Q9UHL4 492 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 HPSEQ9Y251 543 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 POLHQ9Y253 713 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CDY2AQ9Y6F7 541 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TRPM7Q96QT4 1865 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.15□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MCM3APO60318 1980 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CNTNAP1P78357 1384 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ESYT2A0FGR8 921 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CLRN2A0PK11 232 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRSS38A1L453 326 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SMCO2A6NFE2 343 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC154A6NI56 674 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FAM170BA6NMN3 283 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRRT4C9JH25 899 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 BIN1O00499 593 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LAD1O00515 517 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRLP01236 227 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TPM3P06753 285 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LPLP06858 475 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PFKMP08237 780 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MMEP08473 750 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TNFSF4P23510 183 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 AOAHP28039 575 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MCM7P33993 719 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CHKAP35790 457 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PPM1AP35813 382 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PRIM2P49643 509 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 MMP14P50281 582 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF75DP51815 510 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ADCY7P51828 1080 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CASP5P51878 434 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CHRNEQ04844 493 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 STARD3Q14849 445 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SEPT2Q15019 361 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TNIP1Q15025 636 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SNX17Q15036 470 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 POSTNQ15063 836 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.919e-6■□□□□ 10.9
SMYD3-215ENST00000490322 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SPECC1Q5M775 1068 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SLFN13Q68D06 897 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 CIAPIN1Q6FI81 312 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 LUZP1Q86V48 1076 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 ZSCAN30Q86W11 494 aa3.14□□□□□ -1.91
SMYD3-215ENST00000490322 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms