RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TEKT1Q969V4 418 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 PSME4Q14997 1843 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DIRC3C9JPN6 131 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 PPFIA2O75334 1257 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 BAG3O95817 575 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2D6P10635 497 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RBP3P10745 1247 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ECHS1P30084 290 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FLT3LGP49771 235 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 PER3P56645 1201 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RHBDL3P58872 404 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TCP10Q12799 353 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DLGAP5Q15398 846 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TOR2AQ5JU69 321 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 VRK3Q8IV63 474 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TEX11Q8IYF3 940 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GPC2Q8N158 579 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 REPS2Q8NFH8 660 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TSPEARQ8WU66 669 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZG16BQ96DA0 208 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 VEZTQ9HBM0 779 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GAKO14976 1311 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GLTPD2A6NH11 291 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 WNT10BO00744 389 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 B3GALT2O43825 422 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 LPXNO60711 386 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FGAP02671 866 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RPS12P25398 132 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TDO2P48775 406 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RAP2BP61225 183 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FAPQ12884 760 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MUM1Q2TAK8 710 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 SYT12Q8IV01 421 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GPR156Q8NFN8 814 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DPF2Q92785 391 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4K1Q92918 833 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FATE1Q969F0 183 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 VTA1Q9NP79 307 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RFX7Q2KHR2 1363 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RAD50Q92878 1312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE12BA1L429 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM1O75626 825 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 REC8O95072 547 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA10O95299 355 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CPA1P15085 419 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 EPHX2P34913 555 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 AMPD3Q01432 767 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NECTIN1Q15223 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ADRM1Q16186 407 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CSRP2Q16527 193 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CTR9Q6PD62 1173 aa5.52□□□□□ -1.53
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