RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CUL4AQ13619 759 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR68Q15743 365 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 UBXN11Q5T124 520 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 B5MCH6 92 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 TOR1BO14657 336 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 STX16O14662 325 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 P4HA2O15460 535 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 PTP4A3O75365 173 aa6.75□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 IL13P35225 146 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 NPEPPSP55786 919 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED6P86452 979 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 SATB1Q01826 763 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 DNTTP04053 509 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF28P17035 718 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0355O15063 1070 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 RGS10O43665 173 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 SRGAP2O75044 1071 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGGTB-209ENST00000473406 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGB2P05107 769 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTN2P35609 894 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 PGM1P36871 562 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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