RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307		K7ESF4	209 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SOX9	P48436	509 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CASP4	P49662	377 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	USP46	P62068	366 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	TNK2	Q07912	1038 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	TRPC3	Q13507	836 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307		F8VP50	259 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF202	O95125	648 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CNR2	P34972	360 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CXCL12	P48061	93 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CDR1	P51861	262 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	FOXK2	Q01167	660 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	AMPD2	Q01433	879 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	MTF1	Q14872	753 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	EML3	Q32P44	896 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PGAP2-215	ENST00000469307	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307		A8MXQ7	604 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	P4HA1	P13674	534 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	DRD1	P21728	446 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	GTF2H1	P32780	548 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	GRIK1	P39086	918 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	TUB	P50607	506 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	DLG4	P78352	724 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ZXDB	P98169	803 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	SATB1	Q01826	763 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	LRP3	O75074	770 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	AKAP3	O75969	853 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	CKM	P06732	381 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ARSA	P15289	507 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	HDC	P19113	662 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	TGM1	P22735	817 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ANXA13	P27216	316 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ASPA	P45381	313 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	BIRC3	Q13489	604 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	PON2	Q15165	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307		Q6ZS52	159 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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