RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TLE6Q9H808 572 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH9Q9ULB4 789 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 IRAK3Q9Y616 596 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR27A2RRH5 827 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TPM3P06753 285 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PCSK1P29120 753 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GPC1P35052 558 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD23BP54727 409 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPY1Q01534 308 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ROR1Q01973 937 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CREMQ03060 361 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ADCY1Q08828 1119 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB33AQ14088 237 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP6Q16828 381 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 UNC93AQ86WB7 457 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 VSTM4Q8IW00 320 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR65Q8IYL9 337 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 C12orf29Q8N999 325 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM81BQ96LP2 452 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PKMYT1Q99640 499 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 STK33Q9BYT3 514 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR88Q9GZN0 384 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.95□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FSD2A1L4K1 749 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MTMR11A4FU01 709 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35F4A4IF30 521 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MEN1O00255 615 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN5O00501 218 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC01565O15544 149 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TGM5O43548 720 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ABLIM3O94929 683 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC24AO95486 1093 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 VNN2O95498 520 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ADCY5O95622 1261 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 VSIG8P0DPA2 414 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC130P13994 396 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CD19P15391 556 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 EPCAMP16422 314 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ADORA2BP29275 332 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCN4P51793 760 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 JAM2P57087 298 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP27A1Q02318 531 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 HYAL1Q12794 435 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 USP4Q13107 963 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR17Q13304 367 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM171BQ6P995 826 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LILRA6Q6PI73 481 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TMC6Q7Z403 805 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC39CQ8N584 583 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 PPM1EQ8WY54 764 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TFAP2BQ92481 460 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SHC3Q92529 594 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MYLPFQ96A32 169 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 TNIP3Q96KP6 325 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 SPAG5Q96R06 1193 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 MED10Q9BTT4 135 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 ACP6Q9NPH0 428 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP72Q9P209 647 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.94□□□□□ -0.98
ANKRD28-208ENST00000463533 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms