RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PIPSLA2A3N6 862 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM234BA2RU67 622 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC119BA6NIH7 251 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SRGAP2O75044 1071 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 COQ9O75208 318 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP3CBP16298 524 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 EGR1P18146 543 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHA3P29320 983 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC10P48553 1259 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 BCAT1P54687 386 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TAP1Q03518 808 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 BLMHQ13867 455 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 FAXCQ5TGI0 409 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS53Q5VIR6 699 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ERAP2Q6P179 960 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SSH3Q8TE77 659 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CASS4Q9NQ75 786 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CA14Q9ULX7 337 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 NDST3O95803 873 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CSF1RP07333 972 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MAKP20794 623 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC5A2P31639 672 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAPQ12770 1279 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB30Q15771 203 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 VWA1Q6PCB0 445 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 MRGPREQ86SM8 312 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ALG8Q9BVK2 526 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 HPSEQ9Y251 543 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087WZ62 844 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 LPXNO60711 386 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGAMP11215 1152 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATICP31939 592 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM14Q14142 442 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPRRQ15256 657 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZACNQ401N2 412 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 C4orf46Q504U0 113 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MANEALQ5VSG8 457 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ANO1Q5XXA6 986 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 EVI5LQ96CN4 794 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PEX1O43933 1283 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX2O60749 519 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GLP2RO95838 553 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ONECUT2O95948 504 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TYRP1P17643 537 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 AVPR1BP47901 424 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 MTHFSP49914 203 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGA8P53708 1063 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 DGCR2P98153 550 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 21.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ELF2Q15723 593 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC38Q502W7 563 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRED1Q7Z699 444 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.57□□□□□ -1.36
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