RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A27O95847 323 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 APOC2P02655 101 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RBP3P10745 1247 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 WLSQ5T9L3 541 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PDIK1LQ8N165 341 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SPATA18Q8TC71 538 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PAFAH2Q99487 392 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.44■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ADM5C9JUS6 153 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 KRT16P08779 473 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SLC26A2P50443 739 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RIPK1Q13546 671 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RASA2Q15283 850 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 Q3C1V9 767 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MMP19Q99542 508 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MMRN1Q13201 1228 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SETDB1Q15047 1291 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CPB2Q96IY4 423 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.43■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MAP2K2P36507 400 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GPD2P43304 727 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PHKA2P46019 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 NPNTQ6UXI9 565 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ERP27Q96DN0 273 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.42■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 C22orf31O95567 290 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ASRGL1Q7L266 308 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 HPDLQ96IR7 371 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PEBP4Q96S96 227 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RSAD1Q9HA92 442 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 A0A087WZ62 844 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8RI6L899 631 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 P4HA1P13674 534 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MSH2P43246 934 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GABRB2P47870 512 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CDH6P55285 790 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MOGSQ13724 837 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 DPYSL3Q14195 570 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CDO1Q16878 200 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 VSIG1Q86XK7 387 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CHMP2BQ9UQN3 213 aa21.41■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 E7ESA3 106 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 UNC5CO95185 931 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ZWINTO95229 277 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 HMGCRP04035 888 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ROR1Q01973 937 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ACAP1Q15027 740 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RAB6CQ53S08 254 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 CXorf38Q8TB03 319 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 FETUBQ9UGM5 382 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 AKT3Q9Y243 479 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 WDR91A4D1P6 747 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 A8MUI8 341 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 GRAP2O75791 330 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 MCF2P10911 925 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-208ENST00000460766 VDRP11473 427 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms