RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 ZBP1Q9H171 429 aa25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.58■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PATJQ8NI35 1801 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 VNN2O95498 520 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 DNAJB2P25686 324 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MAMLD1Q13495 774 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 HSFY1Q96LI6 401 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PLVAPQ9BX97 442 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 STK39Q9UEW8 545 aa25.57■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 CAPN15O75808 1086 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 OR1D2P34982 312 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PBX2P40425 430 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GNG11P61952 73 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ROR1Q01973 937 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 WDR24Q96S15 920 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 CYLDQ9NQC7 956 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.56■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 WDR27A2RRH5 827 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MTMR11A4FU01 709 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 HHLA1C9JL84 531 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 LILRB3O75022 631 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MTA2O94776 668 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GJB6O95452 261 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 CTSAP10619 480 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 C3orf20Q8ND61 904 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PARVAQ9NVD7 372 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 FANCGO15287 622 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GPR65Q8IYL9 337 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SLC35F6Q8N357 371 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 TRIM7Q9C029 511 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.55■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 F8VP50 259 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GOLGA8SH3BPF8 625 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ACADSBP45954 432 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SMARCB1Q12824 385 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PBX4Q9BYU1 374 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ABCB6Q9NP58 842 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 LZTS1Q9Y250 596 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SCINQ9Y6U3 715 aa25.54■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 LCP1P13796 627 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 TNNT1P13805 278 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 DNAJB1P25685 340 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 TAP1Q03518 808 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 OR6B2Q6IFH4 312 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MIS12Q9H081 205 aa25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 PALMO75781 387 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 BMP8BP34820 402 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 GRIK1P39086 918 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 MAGEA11P43364 429 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RGS19P49795 217 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 SNX16P57768 344 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 ADIGQ0VDE8 80 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 RAB41Q5JT25 222 aa25.52■■□□□ 1.68
NME4-209ENST00000460297 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms