RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 DLK2Q6UY11 383 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNTD1Q8N815 330 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NACC2Q96BF6 587 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPC25Q9HBM1 224 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CA12O43570 354 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS23O95084 383 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NTSR2O95665 410 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 MYL6BP14649 208 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLA2G5P39877 138 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NOMO3P69849 1222 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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RPS3AP53-201ENST00000454716 RAB39AQ14964 217 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPM1NQ8N819 430 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABCC4O15439 1325 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A1W2PS29 197 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHL33A6NCF5 533 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NDUFS2O75306 463 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDK4P11802 303 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 FOLR3P41439 243 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SOX10P56693 466 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACAP2Q15057 778 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 DPF2Q92785 391 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMX3Q96JJ7 454 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 INTS13Q9NVM9 706 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 YDJCA8MPS7 323 aa6.61□□□□□ -1.35
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RPS3AP53-201ENST00000454716 HUNKP57058 714 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 KRT85P78386 507 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIGFQ07326 219 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 GEN1Q17RS7 908 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SSH3Q8TE77 659 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CFAP53Q96M91 514 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 JKAMPQ9P055 326 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NUDCQ9Y266 331 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NUP98P52948 1817 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 GRM6O15303 877 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 MPPED1O15442 326 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRAMEF10O60809 474 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PROP1O75360 226 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 IGLV2-14P01704 120 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANXA1P04083 346 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 KCNA2P16389 499 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 LMO1P25800 156 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NHLH1Q02575 133 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLFN5Q08AF3 891 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 NOGQ13253 232 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 VPS33BQ9H267 617 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.6□□□□□ -1.35
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