RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 LIASO43766 372 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 HUS1O60921 280 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GPD1P21695 349 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 IVDP26440 423 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 COPS2P61201 443 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PTGISQ16647 500 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF365Q70YC5 407 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 USP18Q9UMW8 372 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ATP11AP98196 1134 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SNF8Q96H20 258 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PEBP4Q96S96 227 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ATF2P15336 505 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 OSTM1Q86WC4 334 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 WHRNQ9P202 907 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2C2O75185 946 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 GHRP10912 638 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 KDELR1P24390 212 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CD52P31358 61 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 MGAT3Q09327 533 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 RNF169Q8NCN4 708 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CNPY3Q9BT09 278 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SHBGP04278 402 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 MYZAPP0CAP1 466 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN2P17655 700 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA8P53708 1063 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM110Q86TL2 294 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD6Q8NC69 237 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 MIOSQ9NXC5 875 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PTPN7P35236 360 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CHKAP35790 457 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PLCB3Q01970 1234 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CYB561D2O14569 222 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CST8O60676 142 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC14Q49A88 953 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 WSCD1Q658N2 575 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CAPNS2Q96L46 248 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PWWP2AQ96N64 755 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 CALN1Q9BXU9 219 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PADI3Q9ULW8 664 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SETSIPP0DME0 302 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 LCP1P13796 627 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ETS1P14921 441 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ITIH2P19823 946 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 LRPAP1P30533 357 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 NKX3-2P78367 333 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A3Q01959 620 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 PPARDQ03181 441 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 SLC29A2Q14542 456 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 AAASQ9NRG9 546 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-209ENST00000428120 ARL5CA6NH57 179 aa24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1A2P50993 1020 aa24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SCNN1GP51170 649 aa24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 DENND2CQ68D51 928 aa24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.33■■□□□ 1.48
FAAP20-209ENST00000428120 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms