RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 AP3M2P53677 418 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN10P78369 228 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PKP1Q13835 747 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF516Q92618 1163 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 KLRC4O43908 158 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC3O60645 756 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 AFMP43652 599 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD2Q13200 908 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRPC3Q13507 836 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 EML3Q32P44 896 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 USP18Q9UMW8 372 aa22.38■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 OLFM2O95897 454 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 MYL1P05976 194 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 HDCP19113 662 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 IFNAR2P48551 515 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 USP46P62068 366 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 DMAC2Q9NW81 257 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 USP25Q9UHP3 1055 aa22.37■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 F8VP50 259 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 RNF40O75150 1001 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 EGFP01133 1207 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 GALK1P51570 392 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 MYL6P60660 151 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 LPAL2Q16609 132 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.36■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 A8MXQ7 604 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP3O75969 853 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A9P82251 487 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SPEM2Q0P670 501 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 STK4Q13043 487 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 NR1H3Q13133 447 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CD101Q93033 1021 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PAGE5Q96GU1 130 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC1Q9NV70 894 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.35■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 NFATC1O95644 943 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CMA1P23946 247 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CASP4P49662 377 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZXDBP98169 803 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CSRP2Q16527 193 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 GAB3Q8WWW8 586 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 RTKNQ9BST9 563 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 HPSEQ9Y251 543 aa22.34■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 LEFTY2O00292 366 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PDXKO00764 312 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PHACTR2O75167 634 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 PFKFB1P16118 471 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA2D1P54289 1103 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF699Q32M78 642 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 CEP68Q76N32 757 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 SYT13Q7L8C5 426 aa22.33■■□□□ 1.17
LIMS1-208ENST00000428064 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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