RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 TRPC3Q13507 836 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CPA6Q8N4T0 437 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ECT2Q9H8V3 914 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 EXOC1Q9NV70 894 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 USP25Q9UHP3 1055 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 RAB23Q9ULC3 237 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 HPSEQ9Y251 543 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PFKFB1P16118 471 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CMA1P23946 247 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ANXA13P27216 316 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 GJA4P35212 333 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 CASP4P49662 377 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 KCNB1Q14721 858 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 ATP2A3Q93084 1043 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN4-204ENST00000426921 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 F8VP50 259 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 HRO43593 1189 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 OLFM2O95897 454 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 DRD1P21728 446 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PPP3CCP48454 512 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 LMNB2Q03252 620 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 EML3Q32P44 896 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 EXOC4Q96A65 974 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 A8MXQ7 604 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PDXKO00764 312 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 LRP3O75074 770 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 RETP07949 1114 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 HDCP19113 662 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 IFNAR2P48551 515 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 CACNA2D1P54289 1103 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1B0GVL5 298 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ATG13O75143 517 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PHACTR2O75167 634 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 EGFP01133 1207 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SLC7A9P82251 487 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP8P85298 464 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZXDBP98169 803 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 NCOA4Q13772 614 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 LPAL2Q16609 132 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF699Q32M78 642 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 FBXO43Q4G163 708 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 RNF40O75150 1001 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 VNN1O95497 513 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SDHBP21912 280 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 HOXC13P31276 330 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 GALK1P51570 392 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 KRT85P78386 507 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 BIRC3Q13489 604 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZACNQ401N2 412 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SPATA32Q96LK8 384 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 NR3C1P04150 777 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 TMC2Q8TDI7 906 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 CD101Q93033 1021 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 USP18Q9UMW8 372 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 LEFTY2O00292 366 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN4-204ENST00000426921 CLDN5O00501 218 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms