RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 APOL5Q9BWW9 433 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GLRA3O75311 464 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RARGP13631 454 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TGM2P21980 687 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPZA2P47755 286 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNB3Q05901 458 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ADRM1Q16186 407 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CHSY1Q86X52 802 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC103Q8IW40 242 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX31Q8N9S9 440 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HES6Q96HZ4 224 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP42Q96MM3 310 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HEATR9A2RTY3 570 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF103O00237 685 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PMPCBO75439 489 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA9O76027 345 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2C8P10632 490 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MLH1P40692 756 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCEQ02156 737 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DSG1Q02413 1049 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PWP1Q13610 501 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LUZP2Q86TE4 346 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00523Q86TU6 105 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SYBUQ9NX95 663 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 L1RE1Q9UN81 338 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RREB1Q92766 1687 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLIT2O94813 1529 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF23P17027 643 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RFC5P40937 340 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PRIM2P49643 509 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB14P61106 215 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNJLQ8IV13 435 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SP8Q8IXZ3 490 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC3BQ9H195 1237 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HPS4Q9NQG7 708 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KLK7P49862 253 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FAXCQ5TGI0 409 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR141Q7Z602 305 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6J1Q8NGC5 347 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HAO1Q9UJM8 370 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TFR2Q9UP52 801 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MAFGO15525 162 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXD10P28358 340 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SOAT1P35610 550 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYMQ14894 314 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FAR2Q96K12 515 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 THAP2Q9H0W7 228 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CD248Q9HCU0 757 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PDHBP11177 359 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FDPSP14324 419 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC3P17980 439 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UBA3Q8TBC4 463 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PNKPQ96T60 521 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.39□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FLT1P17948 1338 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms