RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PALM2Q8IXS6 379 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPA2Q8N8Q9 360 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NAT8LQ8N9F0 302 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM134Q9H6X4 195 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PPCSQ9HAB8 311 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PCSK1NQ9UHG2 260 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP69BQ9UJL9 534 aa19.56■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 FYB2Q5VWT5 728 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC45BQ8IWX7 931 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 INPP5DQ92835 1189 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.56■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A7Q9P2U7 560 aa19.56■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG7O95352 703 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 GM2AP17900 193 aa19.55■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 LDLRAD1Q5T700 205 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CYLDQ9NQC7 956 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CYTH4Q9UIA0 394 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NDC80O14777 642 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM189A1O60320 539 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 GJB1P08034 283 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 OSTNP61366 133 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ORC1Q13415 861 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 DUOXA2Q1HG44 320 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF699Q32M78 642 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCP2LQ5T4T6 812 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 BRI3BPQ8WY22 251 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SIP14410 1827 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SOCS7O14512 581 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PAX7P23759 505 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KDELR1P24390 212 aa19.54■□□□□ 0.72
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SH3BP1-202ENST00000417536 BASP1P80723 227 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71DQ8N9W8 422 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 DNERQ8NFT8 737 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RFWD2Q8NHY2 731 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP2BQ9UQN3 213 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX11AO75192 247 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 AP3M2P53677 418 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 BBS12Q6ZW61 710 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNN1Q92952 543 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGC3Q9UN70 934 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 POLIQ9UNA4 740 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD2LO14523 706 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 MSCO60682 206 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TOM1L1O75674 476 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT7P08729 469 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF5Q15542 800 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 HADHQ16836 314 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL38Q2WGJ6 581 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RFX6Q8HWS3 928 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 MZB1Q8WU39 189 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAKDQ8WVC6 231 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 STRIP2Q9ULQ0 834 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0G2JND7 137 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 H0Y3Z8 333 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.723e-19■■■■□ 21.9
SH3BP1-202ENST00000417536 OSBPP22059 807 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPAP45381 313 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF2P50749 326 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF11Q15544 211 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ZPBP2Q6X784 338 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 THNSL1Q8IYQ7 743 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PDIK1LQ8N165 341 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC71Q8N4P6 559 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPH1Q92598 858 aa19.53■□□□□ 0.72
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