RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 NPR3P17342 541 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 RFX1P22670 979 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 KCNMA1Q12791 1236 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SMOQ99835 787 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 IL21Q9HBE4 155 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 HESX1Q9UBX0 185 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 CNTN6Q9UQ52 1028 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.05■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 LGALS16A8MUM7 142 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 F11P03951 625 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 STILQ15468 1287 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGAP44Q17R89 818 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 GJB7Q6PEY0 223 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 CLEC20AQ6ZU45 233 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 TTLL2Q9BWV7 592 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 KCNK12Q9HB15 430 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 PNPLA8Q9NP80 782 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SIX2Q9NPC8 291 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJC12Q9UKB3 198 aa29.04■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 PPP3CCP48454 512 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 APBA1Q02410 837 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 UBXN1Q04323 297 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SLITRK1Q96PX8 696 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 PLCB1Q9NQ66 1216 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 COMMD8Q9NX08 183 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SOBPA7XYQ1 873 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ANHXE9PGG2 379 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 DLL1O00548 723 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 BEST1O76090 585 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.247e-8■■■□□ 17.2
FAAP20-204ENST00000400919 YWHAQP27348 245 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 USP8P40818 1118 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF132P52740 706 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SLC5A3P53794 718 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 FILIP1LQ4L180 1135 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 GPR158Q5T848 1215 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZMIZ2Q8NF64 920 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 TASP1Q9H6P5 420 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 MUTYHQ9UIF7 546 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SORCS3Q9UPU3 1222 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ASGR2P07307 311 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ALADP13716 330 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 USP46P62068 366 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM150AQ86TG1 271 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 LUZP1Q86V48 1076 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SHC3Q92529 594 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCD2Q92925 531 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO44Q9H4M3 255 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.02■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 DOCK6Q96HP0 2047 aa29.01■■■□□ 2.24
FAAP20-204ENST00000400919 O00370 1275 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 UCHL3P15374 230 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 BCAT1P54687 386 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 HTR4Q13639 388 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 CNGA2Q16280 664 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PTPN21Q16825 1174 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 LRSAM1Q6UWE0 723 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ASB16Q96NS5 453 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 UBXN6Q9BZV1 441 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TSPY26PQ9H489 355 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP14Q9HCL3 533 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NUMBLQ9Y6R0 609 aa29.01■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NOTCH4Q99466 2003 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TNFRSF10BO14763 440 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DCXO43602 365 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 CYP4F8P98187 520 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TAF10Q12962 218 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TDGQ13569 410 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FAM78AQ5JUQ0 283 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PARM1Q6UWI2 310 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 PDZD8Q8NEN9 1154 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 ZSWIM3Q96MP5 696 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 IL37Q9NZH6 218 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 MED7O43513 233 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SYCP1Q15431 976 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 STXBP5Q5T5C0 1151 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 SCAMP5Q8TAC9 235 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 OVCA2Q8WZ82 227 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TFAP2BQ92481 460 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FGF14Q92915 247 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO32Q969P5 355 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 E2F7Q96AV8 911 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-204ENST00000400919 TRPV4Q9HBA0 871 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms