RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM72Q6ZMU5 477 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 DNAAF5Q86Y56 855 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 KREMEN2Q8NCW0 462 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SLC22A17Q8WUG5 538 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CPA5Q8WXQ8 436 aa29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 AKR1B10O60218 316 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 LSM8O95777 96 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TCEAL5Q5H9L2 206 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 Q7L0L9 218 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM35BQ8NCS4 154 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A14Q8TBB6 771 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 GPR152Q8TDT2 470 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 KCNF1Q9H3M0 494 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SZT2Q5T011 3432 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 ATF6P18850 670 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PMF1Q6P1K2 205 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PIGZQ86VD9 579 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TCEAL8Q8IYN2 117 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC112Q8NEF3 446 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SLC35F5Q8WV83 523 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 IGFLR1Q9H665 355 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 MAN1C1Q9NR34 630 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 INSL5Q9Y5Q6 135 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.8■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PIK3R2O00459 728 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM66O15016 1216 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 UNGP13051 313 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SLC8A3P57103 927 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PDCLQ13371 301 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TJP2Q9UDY2 1190 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 DOCK6Q96HP0 2047 aa29.79■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 HHLA1C9JL84 531 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 C8AP07357 584 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 IGFBP4P22692 258 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 ANXA13P27216 316 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PLA2G4AP47712 749 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 SLC18A3Q16572 532 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 LIN9Q5TKA1 542 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PPP2R3CQ969Q6 453 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 ST7Q9NRC1 585 aa29.78■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 TUFMP49411 452 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CENPCQ03188 943 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 HYAL1Q12794 435 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 PTPN20Q4JDL3 420 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 C2CD6Q53TS8 623 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 GIPC2Q8TF65 315 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 C8orf48Q96LL4 319 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 CPXM1Q96SM3 734 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 HSFX1Q9UBD0 423 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 NAGPAQ9UK23 515 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 MAFFQ9ULX9 164 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 NENFQ9UMX5 172 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 REV3LO60673 3130 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF263O14978 683 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 GABBR2O75899 941 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 NSFP46459 744 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 TWF1Q12792 350 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC170Q8IYT3 715 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC122Q5T0U0 273 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ACAD10Q6JQN1 1059 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 MICALL1Q8N3F8 863 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 C11orf70Q9BRQ4 267 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 E5RJQ4 531 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 NDUFA10O95299 355 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ALDH1A3P47895 512 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 SLC5A3P53794 718 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 MTMR3Q13615 1198 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 NOX5Q96PH1 765 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 SLC4A5Q9BY07 1137 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 C2orf16Q68DN1 1984 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 LINC01565O15544 149 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 RFPL2O75678 378 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ERBB2P04626 1255 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 LCP1P13796 627 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ADIGQ0VDE8 80 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 CYP4A22Q5TCH4 519 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ERICH1Q86X53 443 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 ACRBPQ8NEB7 543 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 SCAMP5Q8TAC9 235 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 MYLIPQ8WY64 445 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-202ENST00000393028 DESI2Q9BSY9 194 aa29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms