RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NR2E1Q9Y466 385 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 A8MUI8 341 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZBED4O75132 1171 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MYBL1P10243 752 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EPB42P16452 691 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRAP18433 802 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COMTP21964 271 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A2P36021 539 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 BACE1P56817 501 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IRX4P78413 519 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AP1B1Q10567 949 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTP4A2Q12974 167 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAP7Q14244 749 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 Q4G0T1 1027 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ARSHQ5FYA8 562 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TTC27Q6P3X3 843 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf42Q96LP6 360 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 REEP2Q9BRK0 252 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CPVLQ9H3G5 476 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 UTRNP46939 3433 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TM9SF1O15321 606 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CYP1A2P05177 515 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PDHA1P08559 390 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ADCY8P40145 1251 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KRT72Q14CN4 511 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TBCCQ15814 346 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HHATQ5VTY9 493 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4X1Q8N118 509 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NME8Q8N427 588 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRN2Q92932 1015 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OPTNQ96CV9 577 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CDCA5Q96FF9 252 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PARVGQ9HBI0 331 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HAO1Q9UJM8 370 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO1Q9UM00 188 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CHKBQ9Y259 395 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MYPNQ86TC9 1320 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ADM5C9JUS6 153 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GREM1O60565 184 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC6O75061 913 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RNF8O76064 485 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TJP3O95049 919 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TGDSO95455 350 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PYGMP11217 842 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms