RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369442.3

GDAP2-201, Transcript of ganglioside induced differentiation associated protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GDAP2, Length 2,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2-201ENST00000369442 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.52□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.52□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 M0QZ92 97 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MGEA5O60502 916 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ACSL3O95573 720 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 IFNB1P01574 187 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MYZAPP0CAP1 466 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ATF2P15336 505 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CD52P31358 61 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 LILRA4P59901 499 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MTM1Q13496 603 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CCNG2Q16589 344 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KCTD6Q8NC69 237 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 I3L4J1 428 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SEPT4O43236 478 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CST8O60676 142 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ADAMTS4O75173 837 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GPD1P21695 349 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KDELR1P24390 212 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TAF6P49848 677 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GDF10P55107 478 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 IRF5Q13568 498 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 WSCD1Q658N2 575 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ZNF365Q70YC5 407 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SNF8Q96H20 258 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SNX25Q9H3E2 840 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CAND2O75155 1236 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 BEST1O76090 585 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TJP3O95049 919 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GAS8O95995 478 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KCNE1P15382 129 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SCNN1GP51170 649 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GNGT1P63211 74 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GUCY1A3Q02108 690 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 MTMR3Q13615 1198 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 P3H1Q32P28 736 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CCDC14Q49A88 953 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 RFX6Q8HWS3 928 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 NME8Q8N427 588 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 APPL2Q8NEU8 664 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 HASPINQ8TF76 798 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.098e-7■■□□□ 14
GDAP2-201ENST00000369442 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 HESX1Q9UBX0 185 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 NR1D1P20393 614 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CLCNKBP51801 687 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CA9Q16790 459 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 XKR4Q5GH76 650 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 LRRC38Q5VT99 294 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 DENND2CQ68D51 928 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ACTL9Q8TC94 416 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SLCO2A1Q92959 643 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 SPC25Q9HBM1 224 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.5□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CYB561D2O14569 222 aa14.49□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KIF3CO14782 793 aa14.49□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 RNF8O76064 485 aa14.49□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 CD4P01730 458 aa14.49□□□□□ -0.09
GDAP2-201ENST00000369442 KLRC2P26717 231 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms