RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 TEPSINQ96N21 525 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 AGPAT1Q99943 283 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TCHPQ9BT92 498 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 FOCADQ5VW36 1801 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 E5RJQ4 531 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CTNNA2P26232 953 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 HALP42357 657 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ITGA7Q13683 1181 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CMPK2Q5EBM0 449 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 FAM83AQ86UY5 434 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TMEM247A6NEH6 219 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 UQCRBP14927 111 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 GCLMP48507 274 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TMPRSS15P98073 1019 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CNGA3Q16281 694 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 BBS9Q3SYG4 887 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ACAD11Q709F0 780 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 NLRX1Q86UT6 975 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 MYCT1Q8N699 235 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 C17orf50Q8WW18 174 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 WNK4Q96J92 1243 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 SAR1AQ9NR31 198 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TMEM221A6NGB7 291 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 NFIBO00712 420 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 GSTT2P0CG29 244 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 GSTT2BP0CG30 244 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CDK16Q00536 496 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TNFAIP1Q13829 316 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TFDP1Q14186 410 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 LPIN1Q14693 890 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 AGR3Q8TD06 166 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 NACA2Q9H009 215 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 HMGCS2P54868 508 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 NCKAP1LP55160 1127 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 REEP2Q9BRK0 252 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 RNF181Q9P0P0 153 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ABCB11O95342 1321 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 E2F8A0AVK6 867 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 LPXNO60711 386 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 RARBP10826 455 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 HIC1Q14526 733 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 DTNAQ9Y4J8 743 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 SIPA1L1O43166 1804 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 ZBTB39O15060 712 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TP73O15350 636 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CFLARO15519 480 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 AQP5P55064 265 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 APOL6Q9BWW8 343 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 PTTG2Q9NZH5 202 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TRIM17Q9Y577 477 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 TISP43B9A030 160 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 MAPK4P31152 587 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC13-201ENST00000366661 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms