RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ANO5Q75V66 913 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TTC13Q8NBP0 860 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 AK5Q9Y6K8 562 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 E7ESA3 106 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CALCAP01258 141 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CIITAP33076 1130 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SERPINB6P35237 376 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 GJC1P36383 396 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PTK7Q13308 1070 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MECRQ9BV79 373 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PDE5AO76074 875 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SREBF1P36956 1147 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 EPHB1P54762 984 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KRT81Q14533 505 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TEX44Q53QW1 395 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KBTBD6Q86V97 674 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 DDI1Q8WTU0 396 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 USP6NLQ92738 828 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 NLRP4Q96MN2 994 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 POMPQ9Y244 141 aa22.69■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 H3BSA7 217 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 E2F6O75461 281 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ZNF24P17028 368 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ALDH1A3P47895 512 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RHBDL3P58872 404 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TMPRSS15P98073 1019 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 FAAP100Q0VG06 881 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PAOXQ6QHF9 649 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CORO1BQ9BR76 489 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 NYXQ9GZU5 481 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CDH22Q9UJ99 828 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MYPNQ86TC9 1320 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KITP10721 976 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MLH1P40692 756 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ATG16L1Q676U5 607 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 E2F7Q96AV8 911 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TRIM11Q96F44 468 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RILPQ96NA2 401 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 EBF4Q9BQW3 602 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 Q9H521 79 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 THEGQ9P2T0 379 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RAB26Q9ULW5 256 aa22.68■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PCGF5Q86SE9 256 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PALM2Q8IXS6 379 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.226e-7■■■■■ 32
OPN3-201ENST00000366554 IFNB1P01574 187 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ITGAVP06756 1048 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 NR1H2P55055 460 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 GABPAQ06546 454 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 DAW1Q8N136 415 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 HIPK4Q8NE63 616 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CPT1BQ92523 772 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TEKT1Q969V4 418 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KCND2Q9NZV8 630 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CRTAMO95727 393 aa22.66■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 ALCAMQ13740 583 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms