RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 CENPBD1B2RD01 187 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 HAUS5O94927 633 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 FDX1P10109 184 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 JUNDP17535 347 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 VCLP18206 1134 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 EPHB2P29323 1055 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SCNN1AP37088 669 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 GSTO1P78417 241 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 CHSY3Q70JA7 882 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 GPR180Q86V85 440 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 RDH11Q8TC12 318 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 DCAF4Q8WV16 495 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 ACAP3Q96P50 834 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 HIPK3Q9H422 1215 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 STK39Q9UEW8 545 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TMEM247A6NEH6 219 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 CEP104O60308 925 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 RPS6KA4O75676 772 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 PROSCO94903 275 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 A1BGP04217 495 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 MLNP12872 115 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 IL1RNP18510 177 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SLC5A2P31639 672 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 CBX3Q13185 183 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 KCNJ11Q14654 390 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 C18orf8Q96DM3 657 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 HIC2Q96JB3 615 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPN22-201ENST00000359785 WWP1Q9H0M0 922 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SP140LQ9H930 580 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SOX13Q9UN79 622 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 FAM159BA6NKW6 160 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 SEC14L5O43304 696 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 ITM2AO43736 263 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 KLHL41O60662 606 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PTPN22-201ENST00000359785 AKAP3O75969 853 aa4.71□□□□□ -1.65
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