RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349157.10

PUF60-202, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUF60, Length 1,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-202ENST00000349157 SNX1Q13596 522 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TFDP2Q14188 446 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TTMPQ5BVD1 217 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PCGF5Q86SE9 256 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PPEF2O14830 753 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PRKCZQ05513 592 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ZNF844Q08AG5 666 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PTK7Q13308 1070 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TTC30AQ86WT1 665 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 RAPGEF5Q92565 580 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KLK14Q9P0G3 267 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SCN1AP35498 2009 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PRPSAP2O60256 369 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PGK1P00558 417 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 THP07101 528 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 IVDP26440 423 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 MIPP30301 263 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SDC4P31431 198 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PTPN9P43378 593 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 LHX1P48742 406 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ADCY2Q08462 1091 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ALLCQ8N6M5 410 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 C12orf29Q8N999 325 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KCTD6Q8NC69 237 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ARL8AQ96BM9 186 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PGBD4Q96DM1 585 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 RNF39Q9H2S5 420 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.48■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ENDOD1O94919 500 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ASGR1P07306 291 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 CAPN2P17655 700 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 FAM26DQ5JW98 314 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PMF1Q6P1K2 205 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 RNF180Q86T96 592 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KLRC2P26717 231 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PDE4CQ08493 712 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KAZNQ674X7 775 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 EMC1Q8N766 993 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PGM2Q96G03 612 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 ZWILCHQ9H900 591 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 PTGESO14684 152 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 GABRDO14764 452 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 MDM4O15151 490 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TOMM70O94826 608 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 APOC2P02655 101 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KRT10P13645 584 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 TCF4P15884 667 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 GYS2P54840 703 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 KCNA10Q16322 511 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-202ENST00000349157 CYB561D2O14569 222 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-202ENST00000349157 CHRNA1P02708 482 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-202ENST00000349157 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PUF60-202ENST00000349157 NR1D1P20393 614 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-202ENST00000349157 ACTN2P35609 894 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms