RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 VCLP18206 1134 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KLRC2P26717 231 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 SSTR1P30872 391 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PLCB3Q01970 1234 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ITGA9Q13797 1035 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 EPC2Q52LR7 807 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 SFT2D3Q587I9 215 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PDSS2Q86YH6 399 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 HIPK4Q8NE63 616 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 EFR3BQ9Y2G0 817 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.95■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CALCAP01258 141 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MT-ND3P03897 115 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 AQP4P55087 323 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DLG1Q12959 904 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PDK3Q15120 406 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ACAD10Q6JQN1 1059 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 LDHDQ86WU2 507 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TREML1Q86YW5 311 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ASNSP08243 561 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 FDX1P10109 184 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CDK4P11802 303 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KRT5P13647 590 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MTMR2Q13614 643 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 NFIL3Q16649 462 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DNAL1Q4LDG9 190 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 RILPQ96NA2 401 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PAFAH2Q99487 392 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 WDR18Q9BV38 432 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.94■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TISP43B9A030 160 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 FKBP6O75344 327 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KITP10721 976 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 SREBF1P36956 1147 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MXI1P50539 228 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MFAP3P55082 362 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 AP3B2Q13367 1082 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ZNF276Q8N554 614 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 EPB41L1Q9H4G0 881 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CYP3A7P24462 503 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PHBP35232 272 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CHN2P52757 468 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 EMP3P54852 163 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 GAB3Q8WWW8 586 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TBCCD1Q9NVR7 557 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.93■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MEI4A8MW99 385 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 NFIBO00712 420 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 BIRC5O15392 142 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KRT10P13645 584 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 SERPINB6P35237 376 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 DHRS1Q96LJ7 313 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 ALOX15BO15296 676 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 NAT1P18440 290 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 COG7P83436 770 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 TRIP10Q15642 601 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 BANPQ8N9N5 519 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 CPA5Q8WXQ8 436 aa18.92■□□□□ 0.62
PKP3-201ENST00000331563 WNK4Q96J92 1243 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms