RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 CLNKQ7Z7G1 428 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 WDR90Q96KV7 1748 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 CD19P15391 556 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 ILDR2Q71H61 639 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 RSAD1Q9HA92 442 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 NPHS2Q9NP85 383 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 PCK1P35558 622 aa23.58■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.58■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 RNF149Q8NC42 400 aa23.58■■□□□ 1.37
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HOXD1-201ENST00000331462 POLIQ9UNA4 740 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXD1-201ENST00000331462 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.58■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 NOMO1Q15155 1222 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CMPK2Q5EBM0 449 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.58■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 RFX6Q8HWS3 928 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.58■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.56■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.56■■□□□ 1.36
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HOXD1-201ENST00000331462 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 SDCBP2Q9H190 292 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 SUFUQ9UMX1 484 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC42Q9Y546 428 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXD1-201ENST00000331462 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.55■■□□□ 1.36
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