RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA17Q96L03 361 aa23.65■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC8A3P57103 927 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD4-201ENST00000306324 STILQ15468 1287 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXD4-201ENST00000306324 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.64■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.64■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.38
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HOXD4-201ENST00000306324 MED7O43513 233 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GFPT2O94808 682 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 SOX5P35711 763 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 STAT1P42224 750 aa23.63■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 MICAL2O94851 1124 aa23.62■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 NUP93Q8N1F7 819 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 ASB2Q96Q27 587 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 NUP58Q9BVL2 599 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 SP100P23497 879 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 PDE4CQ08493 712 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A9Q2M3M2 681 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF197O14709 1029 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 FIGNQ5HY92 759 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 BAP1Q92560 729 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 EHD2Q9NZN4 543 aa23.6■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 PKDCCQ504Y2 493 aa23.59■■□□□ 1.37
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HOXD4-201ENST00000306324 TAF3Q5VWG9 929 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GAREM2Q75VX8 874 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 PIGZQ86VD9 579 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 GCNAQ96QF7 691 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 IL21Q9HBE4 155 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXD4-201ENST00000306324 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
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