RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 CALN1Q9BXU9 219 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 NRCAMQ92823 1304 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PPEF2O14830 753 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 F2P00734 622 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 APOC2P02655 101 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CENPUQ71F23 418 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 BEST2Q8NFU1 509 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CABS1Q96KC9 395 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 OSMRQ99650 979 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PTPN18Q99952 460 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RSAD1Q9HA92 442 aa25.12■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 SCN1AP35498 2009 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 A6NJR5 290 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PDGFRAP16234 1089 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 IFNAR2P48551 515 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 GDF10P55107 478 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TRNP1Q6NT89 227 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RSAD2Q8WXG1 361 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TBK1Q9UHD2 729 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CREB1P16220 341 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RGS7P49802 495 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC142Q17RM4 750 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ACOT1Q86TX2 421 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4X1Q8N118 509 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 EURLQ9NYK6 297 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 MCF2LO15068 1137 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 SETSIPP0DME0 302 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CYP2C9P11712 490 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB6Q15916 424 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 DYDC1Q8WWB3 177 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 HES2Q9Y543 173 aa25.1■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PKDCCQ504Y2 493 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TTC30AQ86WT1 665 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ZBED8Q8IZ13 594 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 MICALL1Q8N3F8 863 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 MGARPQ8TDB4 240 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 KAT2BQ92831 832 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CNTN3Q9P232 1028 aa25.09■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PRPSAP2O60256 369 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 GRAP2O75791 330 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CPP00450 1065 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 BRAFP15056 766 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CDH6P55285 790 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 HIF1AQ16665 826 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC121Q6ZUS5 278 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ACTL7BQ9Y614 415 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 DPYSL4O14531 572 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ALOX15BO15296 676 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 RECQL4O94761 1208 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 ENDOD1O94919 500 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 TMED2Q15363 201 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 CDO1Q16878 200 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 PMF1Q6P1K2 205 aa25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRIM54-201ENST00000296098 VPS37BQ9H9H4 285 aa25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms