RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 ANKS1AQ92625 1134 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 GLMNQ92990 594 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.26□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.26□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.096e-6■■■■■ 103.4
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LIMD1-201ENST00000273317 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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LIMD1-201ENST00000273317 PRKCEQ02156 737 aa8.25□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 ANGPT1Q15389 498 aa8.25□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.25□□□□□ -1.09
LIMD1-201ENST00000273317 ADCK2Q7Z695 626 aa8.25□□□□□ -1.09
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