RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TRIM9Q9C026 710 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 IL21Q9HBE4 155 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CAPN10Q9HC96 672 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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APOC3-201ENST00000227667 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 ANTXRLA6NF34 631 aa11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 E9PMD0 336 aa11.64□□□□□ -0.55
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APOC3-201ENST00000227667 ATF6P18850 670 aa11.64□□□□□ -0.55
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APOC3-201ENST00000227667 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.64□□□□□ -0.55
APOC3-201ENST00000227667 HMGB4Q8WW32 186 aa11.64□□□□□ -0.55
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