RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRN2Q92932 1015 aa23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54-201ENST00000215941 CNTN3Q9P232 1028 aa23.89■■□□□ 1.42
ANKRD54-201ENST00000215941 DGAT1O75907 488 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 VNN1O95497 513 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PGM1P36871 562 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF132P52740 706 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CACNA2D1P54289 1103 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.89■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 VWA5AO00534 786 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRAP18433 802 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ATG4CQ96DT6 458 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 FGD4Q96M96 766 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 FCHO1O14526 889 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR78Q5VTH9 848 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 SH2D5Q6ZV89 423 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 BBS12Q6ZW61 710 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 C7orf26Q96N11 449 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM4Q9C037 500 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 FZD1Q9UP38 647 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNE2O96020 404 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TCF4P15884 667 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 LIG4P49917 911 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TAZQ16635 292 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 MSS51Q4VC12 460 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF220Q5VTB9 566 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP170P1Q96L14 293 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.87■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT7P08729 469 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PTK7Q13308 1070 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PGM5Q15124 567 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 MCEEQ96PE7 176 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 GPAMQ9HCL2 828 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT82Q9NSB4 513 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 F8VP50 259 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 UPP2O95045 317 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 MYL2P10916 166 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 UBR7Q8N806 425 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 WNK4Q96J92 1243 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CAPN14A8MX76 684 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 BANF1O75531 89 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CIB2O75838 187 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 ACTL9Q8TC94 416 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CGRRF1Q99675 332 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PPME1Q9Y570 386 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PARP14Q460N5 1801 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 PIGRP01833 764 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 INHBAP08476 426 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPINB4P48594 390 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 GBP5Q96PP8 586 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 RMDN3Q96TC7 470 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 C1orf21Q9H246 121 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.85■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 I3L4J1 428 aa23.84■■□□□ 1.41
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGCS2P54868 508 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms