RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 B4GALT3O60512 393 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PLA2G4AP47712 749 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DUSP16Q9BY84 665 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 NFU1Q9UMS0 254 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP8B1O43520 1251 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RNF8O76064 485 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 BEST1O76090 585 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DDHD2O94830 711 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 IL1R2P27930 398 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC8A3P57103 927 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CYP1B1Q16678 543 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ODF2Q5BJF6 829 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 HDXQ7Z353 690 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PIGZQ86VD9 579 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 URGCPQ8TCY9 931 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RAPGEF5Q92565 580 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SCN5AQ14524 2016 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ENPP3O14638 875 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 NPR3P17342 541 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ACAP1Q15027 740 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CDO1Q16878 200 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 METTL23Q86XA0 190 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.834e-8■■■□□ 15.9
SLC25A3-201ENST00000188376 SCLYQ96I15 445 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 HSFY1Q96LI6 401 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CNPY3Q9BT09 278 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CDH9Q9ULB4 789 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRD1A4D1F6 860 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 M0QZQ0 153 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MIPP30301 263 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ACADSBP45954 432 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PLCB3Q01970 1234 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CASP8Q14790 479 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KAZNQ674X7 775 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SEPT8Q92599 483 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PCED1BQ96HM7 432 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CYLDQ9NQC7 956 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT82Q9NSB4 513 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP2K7O14733 419 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CYP11A1P05108 521 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT7P08729 469 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KRT10P13645 584 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 PCSK1P29120 753 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CETN2P41208 172 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNJ1P48048 391 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 EPHB4P54760 987 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP11AP98196 1134 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 DSC1Q08554 894 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 SNX1Q13596 522 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TCTN1Q2MV58 587 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC14Q49A88 953 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 RAB6CQ53S08 254 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-201ENST00000188376 JAMLQ86YT9 394 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms