RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DSEQ9UL01 958 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 AP3M2P53677 418 aa20.2■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 STIM1Q13586 685 aa20.2■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.2■□□□□ 0.82
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