RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeastyeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPQ1YPL179W AGA1P32323 725 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W SDS23P53172 527 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W ZEO1Q08245 113 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YPR063CQ12160 140 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W TIM22Q12328 207 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YBR200W-AQ3E755 54 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.83□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W SEC4P07560 215 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PAU19P0CE85 124 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PAU21P0CE86 164 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PAU22P0CE87 164 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PAU3P25610 124 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.82□□□□□ -1.96not detected
PPQ1YPL179W COX12Q01519 83 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL12BP0CX54 165 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YKR032WP36127 104 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PET8P38921 284 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W VHS2P40463 436 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YGR149WP48236 432 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W THG1P53215 237 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W CSM4Q08955 156 aa2.82□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W Q0255P03881 472 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YCR001WP25347 104 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W ZRT1P32804 376 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RRT13P40042 185 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W CYT2Q00873 224 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W ARL3Q02804 198 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W UPS3Q04006 179 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W GPI19Q04082 140 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W GTO3Q04806 366 aa2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YHR140WP38842 239 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W PAU7P39545 55 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W IRC22P40006 225 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W BRP1P53194 125 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W DIA1P54005 336 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W SCW10Q04951 389 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W DXO1Q06349 442 aa2.8□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W MRPL28P36527 147 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W KEG1P43614 200 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YCR023CP25351 611 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W SUR2P38992 349 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W COX16P47081 118 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YDR366CP87287 132 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W SEN15Q04675 128 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YLR042CQ07990 161 aa2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W GSP1P32835 219 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YER134CP40081 178 aa2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W YPS5P53057 165 aa2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W AIM34Q03673 198 aa2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W WIP1Q2V2P8 89 aa2.78□□□□□ -1.96
PPQ1YPL179W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W KRE9P39005 276 aa2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YNL217WP40152 326 aa2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YIL014C-AQ02598 104 aa2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W POM33Q12164 279 aa2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W ATP16Q12165 160 aa2.77□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YJL028WP47062 111 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W VAM10Q08474 114 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YPR014CQ6B0W2 109 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W SSS1P35179 80 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YER076CP40049 302 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W OST3P48439 350 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W TVP18Q04767 167 aa2.76□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W SAL1D6W196 494 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W SEC72P39742 193 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YCH1P42937 148 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W DCV1P43595 202 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W HAL1Q01766 294 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W MGR2Q02889 113 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W SGF11Q03067 99 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W DGA1Q08650 418 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W PPT2Q12036 173 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YIL134C-AQ45U18 67 aa2.75□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W PFY1P07274 126 aa2.74□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W TEM1P38987 245 aa2.74□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.74□□□□□ -1.97not detected
PPQ1YPL179W YGL118CP53132 145 aa2.73□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YGL088WP53151 121 aa2.73□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W YCR075W-AQ3E830 75 aa2.73□□□□□ -1.97
PPQ1YPL179W UBC5P15732 148 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.9 ms