RNA–Protein interactions for RNA: YOR377W

ATF1, Transcript of Alcohol acetyltransferase, yeast

Gene ATF1, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATF1	YOR377W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	GSC2	P40989	1895 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YBR013C	P38215	129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	COA6	Q3E846	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	MIG3	P39943	394 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	RRT13	P40042	185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	DAN1	P47178	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	UPS3	Q04006	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	TAO3	P40468	2376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	SWD3	P38123	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	PBA1	Q05778	276 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	ATG40	Q99325	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	COX4	P04037	155 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	INO4	P13902	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	QCR10	P37299	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YHP1	Q04116	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	FLO11	P08640	1367 aa		4.71	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	FYV5	P25585	152 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	MIG1	P27705	504 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YEL045C	P32616	141 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	CWP2	P43497	92 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	SOM1	Q05676	74 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	STF2	P16965	84 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	FZF1	P32805	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	CYB5	P40312	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	ATP19	P81451	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YFL065C	P43539	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	GPI19	Q04082	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	ELP6	Q04868	273 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	REE1	P40893	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	MIX14	Q04341	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	PEP8	P40335	379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	IRC23	Q08416	157 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	HUR1	P45820	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	IRC19	Q07843	230 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATF1	YOR377W	FUN14	P18411	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	ASK1	P35734	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	LAA1	P39526	2014 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	MDM35	O60200	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	PAI3	P01094	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YCR043C	P25361	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YBL059W	P34224	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	MID2	P36027	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YER187W	P40102	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	SVP26	P38869	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YCR085W	P25650	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	NRG2	P38082	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	IGO1	P53897	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YKR045C	P36138	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	ECM34	P38728	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YEL067C	P39978	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	VMA21	P41806	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	GRX5	Q02784	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	SSS1	P35179	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YHR180W	P38868	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	PIR1	Q03178	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	ATG41	Q12048	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YNR077C	P53758	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	PRM3	Q08931	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	DAD1	Q12248	94 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATF1	YOR377W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATF1	YOR377W	YML079W	Q03629	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATF1	YOR377W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATF1	YOR377W	MSB2	P32334	1306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATF1	YOR377W	ECM29	P38737	1868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATF1	YOR377W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 145.2 ms