RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C YGR240C-AQ3E786 66 aa0□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C SEC59P20048 519 aa-0.01□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C ERV14P53173 138 aa-0.01□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C YAP3P38749 330 aa-0.02□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C OCA6Q12454 224 aa-0.02□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C POL2P21951 2222 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C CSN9Q03981 162 aa-0.03□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C YLR285C-AQ3E771 56 aa-0.03□□□□□ -2.41
YKL111CYKL111C CYB5P40312 120 aa-0.04□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C ICS3P47034 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YDR010CQ12426 110 aa-0.04□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa-0.04□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YOR376W-AQ3E805 51 aa-0.04□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C GIM4P40005 111 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YGL041C-BQ3E750 60 aa-0.05□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C MYO1P08964 1928 aa-0.05□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YKL044WP36092 106 aa-0.06□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YHR173CP38864 112 aa-0.06□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C PAU12P53343 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C GPI19Q04082 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C SFT1P43682 97 aa-0.07□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C MRPS12P53732 153 aa-0.07□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C TRM732Q03496 1420 aa-0.07□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C GAT4P40569 121 aa-0.08□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C MPC1P53157 130 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C RPS20P38701 121 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C COX23P38824 151 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C SNF11P38956 169 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C VPS55P47111 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C TIM8P57744 87 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C IRA2P19158 3079 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C CSF1Q12150 2958 aa-0.09□□□□□ -2.42
YKL111CYKL111C YJL197C-AP0C5P0 93 aa-0.1□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C RPA12P32529 125 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YHR130CP38834 111 aa-0.1□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C CYC2P38909 366 aa-0.11□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C SAE3P89114 91 aa-0.11□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C CNL1Q06333 122 aa-0.12□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YBR072C-AQ3E794 53 aa-0.12□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C Q0144Q9ZZW2 109 aa-0.12□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C HMRA2P0CY13 119 aa-0.13□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C PCC1Q3E833 88 aa-0.13□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YLR255CO13574 117 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YPL261CQ08976 102 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YLR361C-AQ3E795 98 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C OST5Q92316 86 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C VPS13Q07878 3144 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C ECM5Q03214 1411 aa-0.14□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C PAU24P38155 120 aa-0.15□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C GCV3P39726 170 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C YDR278CQ05612 105 aa-0.15□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C SLO1Q3E784 85 aa-0.15□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C DNA2P38859 1522 aa-0.16□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C TOM1Q03280 3268 aa-0.16□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C TOR1P35169 2470 aa-0.16□□□□□ -2.43
YKL111CYKL111C ACP1P32463 125 aa-0.16□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C SPC24Q04477 213 aa-0.16□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C TY4B-HP0C2J7 1802 aa-0.16□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C URB1P34241 1764 aaKnown RBP-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C TEL1P38110 2787 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C PAU2P32612 120 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C TDA2P40045 126 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YNL190WP53872 204 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C FRQ1Q06389 190 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YLR363W-AQ3E747 85 aa-0.17□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C SNN1P48232 102 aa-0.18□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YGR042WP53227 271 aa-0.18□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C CCW14O13547 238 aa-0.19□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YIR020CP40575 100 aa-0.19□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C NKP2Q06162 153 aa-0.2□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C MRP49P32388 137 aa-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C POP7P38291 140 aa-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YER187WP40102 141 aa-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YGL204CP53089 101 aa-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YRF1-6P53819 1859 aa-0.21□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C YPK9Q12697 1472 aa-0.22□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C SHU1P38751 150 aa-0.22□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C PAM16P42949 149 aa-0.22□□□□□ -2.44
YKL111CYKL111C PAU19P0CE85 124 aa-0.23□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C PAU3P25610 124 aa-0.23□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C DYN2Q02647 92 aa-0.23□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C YIL086CP40503 102 aa-0.24□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C DAD1Q12248 94 aa-0.24□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C YLR099W-AQ3E798 87 aa-0.24□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C RPB11P38902 120 aa-0.25□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C RAD50P12753 1312 aa-0.25□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C RUB1Q03919 77 aa-0.26□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C YLR118CQ12354 227 aa-0.26□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C YAR029WP39549 74 aa-0.27□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
YKL111CYKL111C ADK1P07170 222 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.4 ms